В КНУТД діє три постійно діючих спеціалізованих вчених рад з правом прийняття до розгляду та проведення захисту дисертацій на здобуття наукового ступеня доктора наук та разові спеціалізовані вчені ради з правом прийняття до розгляду та проведення захисту дисертації на здобуття ступеня доктора філософії.